利用直流输电线路的直流功率调制可以有效地抑制交直流互联电网区域间的低频振荡,而如何确定合适的直流调制控制器参数是一个研究难点。在传统的Prony分析方法中引入多信号到基于奇异值-总体最小二乘法(Singular Value Decomposed-total Least Square,SVD-TLS)确定信号阶数的改进Prony算法中,并在考虑系统初始状态的条件下辨识系统降阶传递函数,给出了不依赖电力系统的数学模型而辨识出系统降阶模型的实用步骤,有效的避开了控制器参数在以往设计中的困难。依据辨识所得结果结合极点配置法整定控制器参数。通过理论分析和IEEE四机系统验证了改进多信号Prony算法提高了辨识精度;仿真结果表明互联系统附加参数经过改进算法整定的直流调制控制器可以明显增加交直流互联系统的振荡阻尼,提高系统运行稳定性。